217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2405 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  95.63 
 
 
229 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  96.07 
 
 
229 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  92.17 
 
 
230 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  92.58 
 
 
229 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  81.43 
 
 
234 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
222 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
240 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  80.95 
 
 
233 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
240 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
238 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
238 aa  358  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
240 aa  357  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  92.2 
 
 
240 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  92.16 
 
 
240 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  81.59 
 
 
236 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  63.8 
 
 
232 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  63.56 
 
 
237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  57.46 
 
 
227 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  55.65 
 
 
232 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  59.01 
 
 
221 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  59.01 
 
 
221 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  59.01 
 
 
221 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  59.01 
 
 
221 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  52.89 
 
 
239 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  59.01 
 
 
221 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  57.8 
 
 
228 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  56.28 
 
 
235 aa  228  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  56.28 
 
 
235 aa  228  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  56.28 
 
 
232 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  56.28 
 
 
232 aa  228  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  56.28 
 
 
232 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  56.28 
 
 
232 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  56.28 
 
 
232 aa  228  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  56.09 
 
 
232 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  57.59 
 
 
229 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  57.59 
 
 
243 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  57.33 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  57.4 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  58.96 
 
 
239 aa  221  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  58.96 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  48.42 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  51.22 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  51.6 
 
 
225 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  48.43 
 
 
244 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  48.67 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  48.8 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  48.67 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  41.67 
 
 
219 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  44.61 
 
 
222 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  41.95 
 
 
222 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  41.48 
 
 
224 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  36.13 
 
 
235 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  38.67 
 
 
233 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  39.64 
 
 
249 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  44.71 
 
 
243 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  41.76 
 
 
229 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 
229 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  40.38 
 
 
230 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  35.75 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  38.81 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
230 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  42.02 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  41.4 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  38.78 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  33.66 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  33.8 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  34.13 
 
 
221 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  34.62 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  37.1 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  33.48 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  34.4 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3106  flagellar L-ring protein  37.1 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  35.81 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  34.29 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  35.14 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  33.65 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  37.96 
 
 
231 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  42.46 
 
 
219 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35.48 
 
 
232 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  35.91 
 
 
261 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  35.1 
 
 
224 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 
237 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  36.7 
 
 
231 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  38.43 
 
 
231 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 
240 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  36.82 
 
 
230 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  36.82 
 
 
230 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  37.67 
 
 
231 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  37.61 
 
 
231 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  35.1 
 
 
224 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  37.96 
 
 
231 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 
231 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  38.97 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  34.51 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 
224 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  35.59 
 
 
232 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>