218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0625 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  99.57 
 
 		 235 aa  470  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  91.95 
 
 		 236 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  79.31 
 
 		 232 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  56.09 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  47.83 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  49.16 
 
 		 344 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  46.41 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  47.28 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  49.34 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  45.83 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  49.17 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  45.42 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  45.42 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  47.56 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  47.56 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  44.89 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  43.78 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  44.35 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  44.64 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  42.57 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  44.3 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  40.49 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  41.3 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  41.3 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  42.62 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  44.21 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  49.47 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  44.21 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  41.15 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  44.95 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  42.19 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  44.64 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  44.64 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  44.19 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  48.24 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  44.8 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  36.73 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  45.7 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  47.28 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.18 
 
 		 226 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  32.79 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  37.04 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  35.1 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.21 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  34.72 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  36.7 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  35.35 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  35.98 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  30.57 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  29.65 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  30.54 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.15 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  31.67 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  30.39 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  29.9 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.15 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  29.24 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  31.43 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  30.73 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.34 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  30.95 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  30.95 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  30.95 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  31.02 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  33.14 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  30.15 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  28.88 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  30.51 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  30.58 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  29.41 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  30.36 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  34.55 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  33.94 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  36.59 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  36.59 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>