216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0102 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 
235 aa  478  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  82.55 
 
 
235 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  65.67 
 
 
234 aa  322  3e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  63.4 
 
 
233 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  59.48 
 
 
232 aa  298  6e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  59.05 
 
 
232 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  58.62 
 
 
232 aa  295  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  61.61 
 
 
237 aa  278  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  45.15 
 
 
240 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  34.45 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  34.58 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  36.49 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  35.37 
 
 
234 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  36.02 
 
 
230 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  32.91 
 
 
229 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.75 
 
 
226 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  35.08 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  31.4 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  32.46 
 
 
225 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  33.81 
 
 
229 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.85 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  31.15 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.68 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  32 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  32.26 
 
 
221 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  33.51 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  30.49 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  33.48 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  30.45 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 
236 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  31.33 
 
 
224 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  32.2 
 
 
237 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  29.22 
 
 
230 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 
226 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 
234 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
230 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  30.13 
 
 
232 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  30.04 
 
 
224 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  30.45 
 
 
233 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  34.39 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  29.73 
 
 
236 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  28.4 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
227 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  28.21 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  28.27 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  31.35 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  30.48 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  33.16 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  30.45 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  30.85 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  30.41 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  28.85 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  29.6 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  32.62 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  28.95 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  28.27 
 
 
234 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  29.67 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  30.71 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  26.89 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  30.48 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  29.95 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  32.8 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  29.95 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  29.95 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  30.65 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  29 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  29.26 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  26.56 
 
 
247 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  32.42 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  26.56 
 
 
247 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  28.93 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  30.98 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  29.26 
 
 
217 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  28.82 
 
 
229 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  32.28 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  27.43 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  29.11 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  31.43 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  31.43 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  30.24 
 
 
252 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  28.29 
 
 
252 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  28.33 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  29.41 
 
 
229 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  28.89 
 
 
229 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>