217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3081 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  88.65 
 
 		 229 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  84.28 
 
 		 234 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  89.4 
 
 		 217 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  79.48 
 
 		 224 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  82.94 
 
 		 224 aa  380  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  85.17 
 
 		 224 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  84.69 
 
 		 224 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  83.73 
 
 		 224 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  84.69 
 
 		 224 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  84.69 
 
 		 224 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  84.21 
 
 		 224 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  83.01 
 
 		 224 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  78.18 
 
 		 224 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  75.23 
 
 		 224 aa  358  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  69.95 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  48.25 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  51.16 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  51.82 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.54 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  49.49 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  48.74 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  46.58 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  47.03 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  44.68 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  46.86 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  46.58 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  43.1 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  43.35 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  45.21 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  48.24 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  47.74 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  42.55 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  39.29 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  39.39 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  39.39 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  39.29 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  42.86 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  40.76 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.38 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  38.91 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  44.57 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  38.07 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  35.43 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  37.77 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  38.3 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  38.86 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  37.1 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  38.81 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.94 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  37.26 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  37.17 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  36.73 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  38.07 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  40.21 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  39.67 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  37.79 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  33.51 
 
 		 247 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  38.42 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  38.42 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  39.25 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  32.35 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  41.38 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.3 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  39.25 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  39.25 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  34.67 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  37.12 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  33.67 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  32.64 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  33.64 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  37.26 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  32.44 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  32.73 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  31.9 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  33.04 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  29.18 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  28.69 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.16 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  32.56 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  39.89 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  34.22 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  34.22 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  34.22 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  34.65 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  33.89 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  33.64 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  32.16 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.05 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>