217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1108 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  45.45 
 
 
236 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  47.27 
 
 
234 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  47 
 
 
226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  46.85 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  45 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  45.54 
 
 
229 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  45.5 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  45.95 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  46.33 
 
 
224 aa  194  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  46.95 
 
 
224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  47.42 
 
 
224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  46.95 
 
 
224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  47.42 
 
 
224 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  46.95 
 
 
224 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  46.58 
 
 
231 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  44.7 
 
 
217 aa  191  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  45.33 
 
 
224 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  46.58 
 
 
231 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  45.54 
 
 
224 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  44.25 
 
 
231 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 
230 aa  188  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  45.41 
 
 
224 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  44.25 
 
 
231 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  45.13 
 
 
237 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  45.66 
 
 
231 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  44.69 
 
 
237 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  45.21 
 
 
231 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  45.85 
 
 
224 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  50.26 
 
 
221 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  43.19 
 
 
230 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  49.74 
 
 
221 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  41.41 
 
 
231 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  49.74 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  49.74 
 
 
221 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  44.56 
 
 
229 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  45.79 
 
 
229 aa  174  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  45.79 
 
 
223 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  43.12 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  45.93 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  44.5 
 
 
283 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  43.46 
 
 
220 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  44.93 
 
 
261 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  44.5 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  44.44 
 
 
260 aa  165  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  43.9 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  43.84 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  39.91 
 
 
234 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 
224 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 
220 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  40.09 
 
 
230 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  40.09 
 
 
230 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  39.81 
 
 
220 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  41.83 
 
 
219 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  41.55 
 
 
220 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 
230 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  40.76 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  38.71 
 
 
224 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  42.41 
 
 
207 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  42.41 
 
 
207 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  40.89 
 
 
217 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  39.53 
 
 
218 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  39.9 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  40.2 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  36.23 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.71 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 
232 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  42.47 
 
 
222 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  44.15 
 
 
222 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  33.05 
 
 
250 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  38.01 
 
 
228 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  36.24 
 
 
224 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  44.15 
 
 
222 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  33.48 
 
 
239 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  33.8 
 
 
224 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  34.36 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  35.58 
 
 
233 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  33.9 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  34.26 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  34.2 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  34.2 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  35.11 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  34.88 
 
 
244 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.27 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.27 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  37.37 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  34.75 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  34.05 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  34.32 
 
 
232 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  34.32 
 
 
235 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  34.32 
 
 
232 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  34.32 
 
 
235 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  34.32 
 
 
232 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  34.32 
 
 
232 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  34.32 
 
 
232 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  37.17 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  37.17 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  37.17 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>