215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01293 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  91.89 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  75.21 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  75.21 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  49.74 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  48.74 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  49.24 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  49.75 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  48.24 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  48 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  49.25 
 
 		 217 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  48.51 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  46.73 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  46.73 
 
 		 224 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  46.73 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  46.73 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  46.23 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  46.23 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  45.73 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  45.23 
 
 		 224 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  45.1 
 
 		 224 aa  175  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  46.53 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  44.72 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  46.04 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  46.04 
 
 		 231 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  44.44 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  42.92 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  45.15 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  44.06 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  42.01 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  43.56 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  44.33 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  44.06 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  45.23 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  39.7 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  39.7 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  37.69 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  43.08 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  40.21 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  38.69 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  38.73 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  41.12 
 
 		 232 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  42 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  41.71 
 
 		 221 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  42.7 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  42.35 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  43.98 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  42.35 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  37.56 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  36.36 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  36.65 
 
 		 232 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  40.23 
 
 		 224 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  43.72 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  35.35 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  36.14 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  37.56 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  34.81 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  36.32 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  37.06 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  34.9 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  35.82 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  35.32 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  38.46 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  38.46 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  38.8 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  38.89 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  39.71 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  33.99 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  36.78 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  37.13 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.83 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  36.96 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  36.31 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  35.32 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  36.92 
 
 		 237 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  35.29 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  34.57 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  34.65 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>