218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4104 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  70.39 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  68.93 
 
 		 230 aa  298  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  61.95 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  60.18 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  60.09 
 
 		 221 aa  280  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  60.75 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  49.55 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  46.82 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  41.18 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  39.11 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  36.4 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  38.61 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.44 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.44 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  36.4 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  36.9 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  38.61 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  35.37 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.89 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  32.6 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.75 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  33.88 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  35.94 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  34.6 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  35.9 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  39.25 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  34.5 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  35.94 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  32.91 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  34.9 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  33.61 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  33.47 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  34.91 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  37.95 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  35.42 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  34.78 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  34.86 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  39.46 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  36.98 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  36.29 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  39.46 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  34.78 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  38.71 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  32.2 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  34.63 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  32.9 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  35.06 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  35.19 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  34.63 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  38.46 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  35.42 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  34.06 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  35.19 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  35.29 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  34.76 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  34.2 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  33.74 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  33.81 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  34.41 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  35.65 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  34.41 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  37.31 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  33.19 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  34.98 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.41 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  34.21 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  36.57 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  34.21 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  31.69 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  34.16 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  36.79 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  36.72 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  31.47 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  36.79 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  34.2 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  35.68 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  33.48 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  35.11 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  36.17 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  34.72 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  31.82 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  34.72 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  32.88 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>