217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3094 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  64.6 
 
 		 226 aa  314  8e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  50.43 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  51.33 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  51.98 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  52.61 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  50 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  51.89 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  51.82 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  49.56 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  51.77 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  52.13 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  52.13 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  51.18 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  52.56 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  50.71 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  50.23 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  51.83 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  51.49 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  45.53 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  44.44 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  45.53 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  45.11 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  44.44 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  44.02 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  45.02 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  43.05 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  44.26 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  46.95 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  46.92 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  43.64 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  43.19 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  43.64 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  46.23 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  44.88 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  45.1 
 
 		 283 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  46.53 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  44.54 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  41.63 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  43.23 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  41.3 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  41.3 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  44.78 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  41.47 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  42.93 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  41.92 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  40.83 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  36.51 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  40.61 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  37 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  39.82 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  39.82 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  38.92 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  40.1 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  41.12 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  38.01 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  36.05 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.06 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  42.08 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  37.37 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  43.75 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  38.69 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  37.44 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  42.61 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  42.61 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  38.19 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  38.69 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  38.19 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  38.19 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  36.7 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  37.55 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  37.69 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  37.19 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  37.44 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  41.38 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  41.11 
 
 		 207 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  41.11 
 
 		 207 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  35.27 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  32.38 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  35.29 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  39.79 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  35.37 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  35.37 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  35.22 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  36.1 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  39.33 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  41.86 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>