219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1429 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  48.4 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  48.39 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  48.39 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  48.39 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  46.99 
 
 		 246 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  55.56 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  50.23 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  48.87 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  48.18 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  47.51 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  49.78 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  47.51 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  44.76 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  48.42 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  46.61 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  45.8 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  47.03 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  44.4 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  43.98 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  44.49 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  44.63 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  44.05 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  44.05 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  42.39 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  44.98 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  40.59 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  42.45 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  41.08 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  42.8 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.99 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  42.92 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  42.92 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  43.91 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  43.21 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  39.17 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  42.54 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  37.6 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  41.6 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  40.53 
 
 		 344 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  40.42 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  39.26 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  36.6 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  36.17 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  37.56 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.5 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  38.58 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.6 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.73 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  39.11 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  32.76 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  35.05 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35.33 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  33.95 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  31.8 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  29.61 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  36.51 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  33.95 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  29.61 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.02 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  29.18 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  34.39 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  29.79 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  31.38 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.89 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  30.8 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  35.59 
 
 		 192 aa  95.5  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  34.38 
 
 		 219 aa  95.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.64 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  35.08 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  34.04 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  32.84 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  32.35 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.89 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  32.35 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  33.52 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  29.55 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  32.68 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  32.35 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  33.61 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  32.35 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  33.52 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  33.15 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  30.09 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  28.57 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>