218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1327 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  95.09 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  97.77 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  94.64 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  92.41 
 
 		 224 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  92.41 
 
 		 224 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  91.96 
 
 		 224 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  92.41 
 
 		 224 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  94.2 
 
 		 224 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  80.8 
 
 		 234 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  79.02 
 
 		 224 aa  387  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 229 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  78.57 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  81.69 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  80.65 
 
 		 217 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  71.43 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  53.02 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  48 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  48.87 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  47.77 
 
 		 231 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  47.77 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  47.32 
 
 		 231 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  48 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  47.56 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  46.43 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  46.35 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  46.81 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.05 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  43.1 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  45.41 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  43.53 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  45.73 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  43.75 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  44.72 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  45.23 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  37.99 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  43.13 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  38.16 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  38.49 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  41.82 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  41.82 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  36.17 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  42.79 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  40.26 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.87 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  42.93 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  37.84 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  37.33 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  36.11 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  36.17 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  34.67 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  37.27 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  40.82 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  36.02 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.29 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  37.99 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  38.56 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  35.37 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  34.5 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  36.07 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  37.22 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  29.75 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  38.77 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  35.09 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  35.53 
 
 		 247 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  35.53 
 
 		 247 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  36.11 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  38.8 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  36.77 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.94 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  37.86 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  36.1 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  41.99 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  36.48 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  32.65 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  39.36 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  35.4 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  36.04 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  28.16 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  36.59 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  36.04 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  36.06 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  31.3 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  36.06 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  36.06 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  36.06 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  36.23 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  36.06 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  36.06 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  36.09 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  33.77 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  35.1 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  35.29 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  35.29 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>