219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0212 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  59.19 
 
 		 221 aa  262  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  59.19 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  60.29 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  58.96 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  58.17 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  57.77 
 
 		 221 aa  241  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  53.4 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  51.69 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  48.21 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  48.21 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  48.62 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  48.6 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  45.97 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  45.66 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  50 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  42.73 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  41.78 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  50.24 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  40.6 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  38.03 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  38.03 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  37.61 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  41.51 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  38.63 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  39.74 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  37.18 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  38.03 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  41.15 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  40.69 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  41.28 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.33 
 
 		 283 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  40.86 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  40.32 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  40.53 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  39.83 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  38.94 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  38.67 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  37.79 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  37.13 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  41.18 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  37.05 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  43.23 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  43.23 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  37.97 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  38.05 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  37.05 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  36.94 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  35.48 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  36.92 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  36.45 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  36.45 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.59 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.73 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  41.09 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  37.7 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  39.18 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  34.77 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  34.77 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  36.61 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  42.77 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  36.61 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  36.61 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  36.61 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  35.34 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  35.83 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  41.92 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  37.56 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  37.86 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  37.76 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  35.94 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  37.97 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  36.68 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  40.56 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  35.56 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  34.39 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.37 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  33.77 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  36.41 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  35.03 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  36.96 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>