219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1381 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  87.7 
 
 		 252 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  87.7 
 
 		 252 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  86.9 
 
 		 252 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  82.94 
 
 		 252 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  82.14 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  80.72 
 
 		 259 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  66.1 
 
 		 246 aa  327  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  65.31 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  65.31 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  65.71 
 
 		 250 aa  326  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  65.15 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  66.23 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  51.5 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  49.57 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  53.07 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  43.31 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  47.51 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  45.15 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  42.73 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  42.58 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  42.73 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  42.19 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  44.58 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  42.13 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  40.4 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  40.59 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  45.09 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  42.98 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  44.1 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  41.83 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  44.1 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  44.3 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  44.98 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  42.61 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  42.73 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.1 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  43.22 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  40.33 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  43.41 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  34.44 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.38 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.24 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  36.18 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  35.83 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  37.19 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  35.9 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  34.31 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  34.02 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.88 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  36.57 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  31.76 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  33.5 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  35 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  36.02 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  32.86 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 192 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  31.92 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  32.39 
 
 		 229 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  30.68 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  30.68 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  35.68 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  32.06 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  37.77 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  32.28 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  33.48 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.46 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  31.02 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  29.2 
 
 		 219 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.48 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  31.58 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  34.55 
 
 		 219 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  29.23 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7233  putative flagellar L-ring protein FlgH  30.4 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  28.74 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  32.09 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  34.05 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  34.05 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  32.69 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  33.54 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  32.26 
 
 		 220 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  28.9 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  27.24 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  34.3 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  27.31 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  27.31 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  29.25 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  30.85 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  28.29 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  31.68 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>