217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3474 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  49.12 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  48.54 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  46.06 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  49.14 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  46.44 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  45.23 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  46.44 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  44.13 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  46.44 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  44.53 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  44.05 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  46.28 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  45.87 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  48.48 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  43.19 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  42.54 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  43.05 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  43.05 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  41.03 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  38.91 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  37.92 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  39.44 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  37.92 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  37.08 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  37.65 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  35.98 
 
 		 344 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  37.25 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  35.74 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  37.56 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  38.03 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  38.33 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  37.93 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  37.93 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  36.55 
 
 		 233 aa  148  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  38.46 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  35.66 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  36.91 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  36.91 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  29.71 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.33 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  32.37 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  33.86 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  31 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  30.92 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.47 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  27.35 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  27.35 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  27.76 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  30.05 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.01 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  30.37 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  31.79 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  32.23 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  32.21 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  31.07 
 
 		 192 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  25.77 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  27.57 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  30.69 
 
 		 237 aa  95.5  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  33 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  33 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  33 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  33 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  33.5 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  29.44 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  32.08 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  33.8 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  26.5 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  32.82 
 
 		 230 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  31.65 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  31.32 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  31.5 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  30 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  25.7 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  28.8 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  30.26 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  30.26 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  30.57 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  30.23 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  29.69 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  32.5 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  29.77 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  28.46 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>