217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1685 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  58.19 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  56.09 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  56.36 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  55.96 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  53.02 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  52.97 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  53.12 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  51.9 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  53.78 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  53.33 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  51.71 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  49.58 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  49.58 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  51.03 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  47.81 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  45.41 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  42.57 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  42.23 
 
 		 259 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  41.43 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  41.37 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  41.37 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  41.67 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  42.22 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  42.5 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  39.58 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  40.33 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  42.86 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  40.76 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  39.08 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  40.83 
 
 		 252 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  41.13 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  41.13 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  39.92 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  39.83 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  43.8 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  41.15 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  43.11 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  38.7 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  34.85 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  34.2 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.1 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  34.78 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  35.15 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.76 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  33.66 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  32.81 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.32 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  33.87 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  30 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  27.76 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  31.09 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  26.29 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  29.52 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  32.77 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  30.17 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  32.5 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  27.75 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  27.31 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  33.55 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  33.55 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  27.46 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  29.02 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  26.72 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.16 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  28.49 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  32.62 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  26.94 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  31.91 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  27.46 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  27.05 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  26.42 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  26.18 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  26.42 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  26.42 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  28.14 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  28.76 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  27.88 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  31.03 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  27.85 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  28.81 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  31.35 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  32.83 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  27.73 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  27.35 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  27.43 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  26.47 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>