217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1101 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 234 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  53.02 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  49.79 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  49.79 
 
 		 344 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  50.42 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  50.43 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  48.5 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  49.78 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  48.5 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  51.54 
 
 		 235 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  48.95 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  49.15 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  48.31 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  47.28 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  47.75 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  46.79 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  43.15 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  43.4 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  43.33 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  43.15 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  41.98 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  43.5 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  42.61 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  44.09 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  40.87 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  41.99 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  41.39 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  41.56 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  41.39 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.53 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  42.79 
 
 		 239 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  42.79 
 
 		 239 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  41.96 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  43.42 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  38.27 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  39.26 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  31.91 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  33.98 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  32.92 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  33.33 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  32.37 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.96 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  35.29 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  34.8 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  33.61 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  31.3 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  33.2 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  29.17 
 
 		 237 aa  98.2  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  37.22 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  31.95 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  33.73 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  29.74 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  36.67 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  31.58 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  36.11 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  30.89 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  30.5 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  28.12 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  29.52 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  28.63 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  28.09 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  30.15 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  28.26 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  29.69 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  29.69 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  27.8 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  28.74 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.53 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  27.6 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  29.17 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  28.44 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  28.26 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  29.17 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  27.83 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  29.18 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  29.29 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  32.56 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  29.17 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  34.34 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  29.69 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  28 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  29.07 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  28.07 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  32.74 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  35 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  30.64 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>