219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1119 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  87.7 
 
 		 252 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  83.73 
 
 		 252 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  84.52 
 
 		 252 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  82.94 
 
 		 252 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  82.94 
 
 		 252 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  76.26 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  64.49 
 
 		 250 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  64.49 
 
 		 250 aa  321  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  64.9 
 
 		 250 aa  321  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  65 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  63.27 
 
 		 246 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  64.68 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  51.08 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  48.26 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  44.53 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  47.51 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  43.14 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  42.75 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  42.52 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  45.3 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  45.3 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  43.46 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  41.2 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  40.59 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  41.83 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  42.15 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  41.74 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  41.67 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  39.84 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  41.67 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.95 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  42.92 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  42.86 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  39.11 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  42.19 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  40.83 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  43.41 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  42.79 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  39.83 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  32.77 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.89 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.47 
 
 		 226 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.76 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  35.29 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  35.42 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  33.75 
 
 		 238 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  36.18 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  32.99 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  34 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.63 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.58 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  33.51 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  34.93 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  31 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.21 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.26 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  30.88 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.34 
 
 		 237 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  32.97 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  31.92 
 
 		 229 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  30.15 
 
 		 235 aa  95.5  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  31.43 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  30.98 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  36.13 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  30.98 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  32.39 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  30.43 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  29.64 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  28.68 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  27.94 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  29.25 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  27.09 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  30.6 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  39.66 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  39.66 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.51 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  29.47 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  31.82 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  27.01 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  32.14 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  31.9 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  32.43 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  30.8 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  32.26 
 
 		 220 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  29.84 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.82 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  28.45 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  32.56 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>