214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0786 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 
232 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  99.57 
 
 
232 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  97.84 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  74.14 
 
 
233 aa  361  5.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  61.04 
 
 
235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  60 
 
 
234 aa  298  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  59.05 
 
 
235 aa  296  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  61.57 
 
 
237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 
240 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  38.66 
 
 
231 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.19 
 
 
226 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  33.91 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
238 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.78 
 
 
229 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  32.6 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  32.76 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  37.43 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.7 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  31.91 
 
 
229 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35.71 
 
 
232 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  34.78 
 
 
230 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.49 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  31.36 
 
 
219 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  31.02 
 
 
229 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  35.08 
 
 
255 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  28.87 
 
 
234 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  32.16 
 
 
239 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  32.26 
 
 
229 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 
250 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  31.75 
 
 
250 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  32.74 
 
 
230 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 
250 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  30.09 
 
 
229 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  29.73 
 
 
230 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  30.7 
 
 
237 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  28.81 
 
 
235 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  31.84 
 
 
235 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  27.35 
 
 
234 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  31.94 
 
 
249 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  32.99 
 
 
246 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 
252 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  30.13 
 
 
234 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  28.5 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  31.52 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  30.41 
 
 
226 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  27.54 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  31.88 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  29.74 
 
 
234 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  32.11 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  31.12 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  30.33 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  31.63 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  27.27 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  29.55 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  32.17 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  31.08 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  28.89 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  26.58 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  29.92 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  30.91 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  26.79 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  27.75 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  29.33 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  30.98 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  29.33 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  27.23 
 
 
224 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
229 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  29.9 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  29.9 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  29.89 
 
 
252 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  25.86 
 
 
224 aa  92  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 
229 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  30.81 
 
 
259 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  27.88 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  28.34 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  29.36 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  26.7 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  27.81 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  27.81 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  27.81 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  27.81 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  27.81 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  30.86 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>