217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4193 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  65.28 
 
 		 232 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  63.64 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  60.39 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  58.45 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  56.76 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  57.97 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  57.49 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  57.21 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  57.21 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  57.49 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  57.49 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  57.49 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  56.67 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  56.67 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  56.67 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  56.67 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  58.57 
 
 		 222 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  58.25 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  58.57 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  56.67 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  56.46 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  56.81 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  56.07 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  56.89 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  57.96 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  57.48 
 
 		 235 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 235 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  57.48 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  57.48 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  57.48 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  54.94 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  57.87 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  54.21 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  56.19 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  56.28 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  52.05 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  51.72 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  51.29 
 
 		 247 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  51.29 
 
 		 247 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  51.85 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  46.95 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  45.41 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  38.08 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  39.38 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  39.66 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  39.64 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  43.48 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  39.62 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  43.71 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  41.94 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  40.09 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  38.5 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  40 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  38.84 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  38.01 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  34.11 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  36.75 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  37.95 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  40.43 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  33.96 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  39.81 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  37.95 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  35.25 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  37.63 
 
 		 230 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  38.7 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  34.98 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  35.94 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  33.94 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  35.05 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  36.82 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  36.4 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.42 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  33.49 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  33.8 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  36.96 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  33.64 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  33.95 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  33.95 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  35.11 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  32.19 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  37.25 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  30.57 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  35.84 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  33.18 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>