216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1277 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  91.82 
 
 		 232 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  93.18 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  93.18 
 
 		 235 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  92.73 
 
 		 232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  93.18 
 
 		 235 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  93.18 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  93.18 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  93.18 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  93.18 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  92.31 
 
 		 235 aa  400  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  81.65 
 
 		 243 aa  347  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  81.65 
 
 		 229 aa  347  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  80.45 
 
 		 233 aa  343  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  75.23 
 
 		 239 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  78.77 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  74.3 
 
 		 228 aa  316  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  77.83 
 
 		 237 aa  315  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  64.93 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  61.32 
 
 		 237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  59.91 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  60.75 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  62.38 
 
 		 229 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  57.48 
 
 		 227 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  57.14 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  59.52 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  59.52 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  59.05 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  59.05 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  59.05 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  59.13 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  55.05 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  58.17 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 240 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  59.24 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  59.05 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  50.88 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  50 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  50.7 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  50.7 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  44.49 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  43.46 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  45.37 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  44.24 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  43.26 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  39.29 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  41.12 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  41.89 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  45.03 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  39.37 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  36.61 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  39.39 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  41.62 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3106  flagellar L-ring protein  36.16 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  42.55 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  38.96 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  39.91 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  40.7 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  41.98 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  38.74 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 		 261 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  40.7 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  41.33 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  36.4 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  39.46 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  37.33 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  40.43 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  37.75 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  36.04 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  39.7 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  35.35 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  35.81 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  36.8 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  35.81 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  35.65 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  35 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  35.16 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  35.71 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  35.21 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  35.59 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  37.17 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  34.55 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  33.64 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>