216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2592 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  96.62 
 
 		 237 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  80.83 
 
 		 239 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  83.18 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  83.18 
 
 		 229 aa  349  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  79.04 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  76.23 
 
 		 228 aa  334  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  73.42 
 
 		 232 aa  332  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  76.71 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  76.71 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  76.71 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  76.71 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  76.71 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  75.23 
 
 		 232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128405 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  74.77 
 
 		 235 aa  318  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  74.77 
 
 		 235 aa  318  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  74.77 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  74.77 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  74.77 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  74.77 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  74.77 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  75.11 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  60.27 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  60.54 
 
 		 232 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  61.32 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  58.41 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  59.19 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  56.28 
 
 		 227 aa  232  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  60.58 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  56.05 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  58.65 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  58.17 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  58.65 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  58.65 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  57.69 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  59.81 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  57.21 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  57.55 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  57.35 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  51.5 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  50.85 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  50.85 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  53.74 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  49.57 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  45.02 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  41.48 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  40.61 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  45.65 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  44.19 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  42.79 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  46.15 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  46.89 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  41.88 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  38.72 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  38.91 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  43.32 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  38.33 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  38.33 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  38.33 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3106  flagellar L-ring protein  37.95 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  37.5 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  37.39 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  37.92 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  38.12 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  33.62 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  35.43 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  35.14 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  35.54 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  40.28 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  35 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  39.78 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  34.36 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  36.07 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  39.8 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  35.09 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  34.63 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  32.95 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  33.78 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 		 224 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  37.99 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  34.93 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  40.56 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  34.53 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>