218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1167 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  79.91 
 
 		 224 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  79.02 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  79.91 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  79.02 
 
 		 224 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  77.23 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  75.98 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  79.91 
 
 		 224 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  78.18 
 
 		 229 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  78.08 
 
 		 229 aa  358  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  77.62 
 
 		 217 aa  350  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  72.32 
 
 		 224 aa  348  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  49.13 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  52.51 
 
 		 226 aa  228  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  50.23 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  46.38 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  45.53 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  45.96 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  46.52 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  45.42 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  47.32 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.5 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  49.49 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  43.56 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  43.53 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  48.74 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  48.24 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  48.74 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  42.86 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  40.77 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  40.77 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  41.63 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  43.4 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  41.55 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  39.73 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  43.48 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  38.74 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  38.74 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  40 
 
 		 283 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  39.74 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  41.95 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  37.23 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  37.83 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  34.47 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  40.54 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  35.96 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  42.13 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  40.09 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  38.16 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  38.86 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  34.98 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  34.03 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  37.61 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  35.65 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  35.65 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  35.65 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  42.22 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  35.1 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  34.76 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  31.25 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  39.25 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  32.9 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  39.38 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  39.38 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  39.08 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  35.11 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.91 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  32.05 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  33.48 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.12 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  32.03 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  30.57 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  30.67 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  33.63 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  39.71 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  32.88 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  31.56 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  32.88 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  34.7 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>