217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1265 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  99.11 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  95.09 
 
 		 224 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  94.64 
 
 		 224 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  96.43 
 
 		 224 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  93.75 
 
 		 224 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  92.86 
 
 		 224 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  93.75 
 
 		 224 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  93.3 
 
 		 224 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  82.59 
 
 		 234 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  80.35 
 
 		 229 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  79.91 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  79.04 
 
 		 229 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  82.55 
 
 		 217 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  71.43 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  48.89 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  51.77 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  50.22 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  49.12 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  49.12 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  48.67 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  47.35 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  48.89 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  47.32 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  48.44 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  47.23 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  46.4 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  45.26 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  45.26 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  46.12 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  47.24 
 
 		 261 aa  187  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  45.5 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  46.23 
 
 		 259 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  46.73 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  43.06 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  39.32 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  39.32 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  39.75 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  38.33 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  43.75 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  41.82 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  41.82 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  40.69 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.87 
 
 		 283 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  43.94 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  39.55 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  39.11 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  36.57 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  37.02 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  37.5 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.77 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  40.82 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  35.09 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  37.29 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  35.65 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  37.28 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  30.58 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  39.89 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  36.57 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.62 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  37.29 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  36.84 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  36.84 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  36.53 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  33.47 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  37.44 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  42.54 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  35.4 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  39.15 
 
 		 217 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  39.89 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  38.05 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  36.67 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  34.96 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  29.13 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  40.31 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.35 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  40.31 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  34.43 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  34.98 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  38.98 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  35.14 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  35.14 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>