213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0563 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  72.22 
 
 
237 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  59.45 
 
 
235 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3106  flagellar L-ring protein  56.82 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  56.82 
 
 
238 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  56.74 
 
 
224 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  53.78 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  56.36 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  39.22 
 
 
225 aa  164  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  42.54 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  44.64 
 
 
243 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  44.64 
 
 
229 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  37.22 
 
 
219 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  40.42 
 
 
234 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  40.08 
 
 
247 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  40.08 
 
 
247 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  44.89 
 
 
233 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  41.59 
 
 
232 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  41.23 
 
 
244 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  43.22 
 
 
232 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  43.38 
 
 
237 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  42.99 
 
 
239 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  43.16 
 
 
230 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  45.05 
 
 
232 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 
233 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  42.23 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  40.29 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  40.29 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
236 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  40.29 
 
 
229 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  42.47 
 
 
235 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  42.11 
 
 
229 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  41.59 
 
 
221 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
240 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  41.59 
 
 
221 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  41.59 
 
 
221 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  42.63 
 
 
229 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  41.59 
 
 
221 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
240 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
238 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
240 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
238 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  41.59 
 
 
221 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  42.06 
 
 
232 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  42.06 
 
 
235 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 
232 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
222 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 
232 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 
232 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 
232 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  44.94 
 
 
240 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  42.06 
 
 
232 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 
235 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  44.38 
 
 
240 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  38.43 
 
 
224 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  39.81 
 
 
227 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  42.08 
 
 
228 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  41.01 
 
 
222 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  47.46 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  43.89 
 
 
222 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  44.12 
 
 
239 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  33.94 
 
 
234 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  36.96 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  30.74 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  31.14 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  35.84 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
230 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  34.23 
 
 
226 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  31.96 
 
 
226 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  35.23 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.87 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  32.55 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
221 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
221 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  34.67 
 
 
231 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  30.04 
 
 
230 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  34.98 
 
 
207 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  34.98 
 
 
207 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 
231 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  32.23 
 
 
260 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  33.78 
 
 
231 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  31.52 
 
 
230 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  31.28 
 
 
259 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
230 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
230 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  31.98 
 
 
228 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  31.98 
 
 
221 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  32.54 
 
 
224 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  33.18 
 
 
231 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  31.56 
 
 
229 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  29.15 
 
 
231 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  31.8 
 
 
224 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  32.22 
 
 
238 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  31.96 
 
 
231 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 
232 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  32.35 
 
 
220 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  32.24 
 
 
231 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  29.03 
 
 
224 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  35.81 
 
 
240 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
234 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>