217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2312 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  72.32 
 
 		 224 aa  348  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  70.98 
 
 		 224 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  69.87 
 
 		 234 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  70.54 
 
 		 224 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  71.43 
 
 		 224 aa  334  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  70.98 
 
 		 224 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  70.98 
 
 		 224 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  71.43 
 
 		 224 aa  329  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  69.64 
 
 		 224 aa  328  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  70.54 
 
 		 224 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  69.64 
 
 		 224 aa  328  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  70.09 
 
 		 224 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  71.63 
 
 		 229 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  69.77 
 
 		 217 aa  320  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  69.95 
 
 		 229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  54.67 
 
 		 236 aa  255  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  52.21 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  50 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  48.93 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  48.93 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  46.75 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  47.21 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  48.73 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  45.89 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  45.02 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  45.45 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  45.7 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  46.15 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  45.98 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.41 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  47.45 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  46.73 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  47.21 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  45.1 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  44.98 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  40.77 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  39.47 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  42.93 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  43.75 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  41.2 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  41.2 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  40.61 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  40.27 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  40.19 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.71 
 
 		 283 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  37.7 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  42.48 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  36.89 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  40.65 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  40.87 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  38.74 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  37.28 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  38.84 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  36.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  40.19 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  36.4 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  36.64 
 
 		 250 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  38.43 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  38.86 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  39.41 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  39.41 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  40.96 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  38.1 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  38.25 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  40.2 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  34.47 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  37.27 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  33.48 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  33.48 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  40.43 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  35.68 
 
 		 244 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  40.43 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  34.12 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  30.83 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  37.81 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.65 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  37.33 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  38.57 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  36.99 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  36.99 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  35.29 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.17 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  36.82 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  32.6 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  30.51 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  36.28 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  37.8 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.94 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  35.75 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  38.95 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>