218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1309 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  78.12 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  79.91 
 
 		 224 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  80.36 
 
 		 224 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  79.91 
 
 		 224 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  79.46 
 
 		 224 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  77.23 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  78.57 
 
 		 224 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  75.11 
 
 		 234 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  79.02 
 
 		 224 aa  362  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  73.8 
 
 		 229 aa  359  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  75.23 
 
 		 229 aa  358  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  76.04 
 
 		 217 aa  358  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  70.54 
 
 		 224 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  48.9 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  49.56 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  48.37 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  45.92 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  45.92 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  46.33 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  50 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.81 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  43.28 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  42.44 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  42.44 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  45.09 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  48.24 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  43.15 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  44.2 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  48.51 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  48.51 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  43.69 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  40.97 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  40.97 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  42.17 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  43.5 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  39.06 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  42.17 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  44.93 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  41 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  40.1 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  36.71 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  38.6 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  39.51 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  35.87 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  39.17 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  37.9 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  35.93 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  37.67 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  37.61 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  39.25 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  35.08 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  38.6 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  38.01 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  38.97 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  34.65 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  38.1 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  37.61 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  32.04 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  35.19 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  39.62 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  35.44 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.72 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.72 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  38.66 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  33.19 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  35.84 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  34.1 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  34.78 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  36.29 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  38.71 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  38.71 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  36.44 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  36.44 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  36.44 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  36.44 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  36.44 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  38.71 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.64 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  32.72 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  33.77 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  35.05 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  28.51 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  32.74 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  34.51 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  34.51 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.87 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  40 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.3 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.14 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  35.5 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>