215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3577 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  100 
 
 
283 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  45 
 
 
240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  45.1 
 
 
230 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  44.5 
 
 
230 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  42.99 
 
 
237 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  43.46 
 
 
231 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  42.13 
 
 
221 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  45.45 
 
 
231 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  42.99 
 
 
231 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  42.52 
 
 
231 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  42.06 
 
 
237 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  42.52 
 
 
231 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  42.57 
 
 
226 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  43.54 
 
 
231 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  40.39 
 
 
236 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  42.13 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  42.36 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  41.38 
 
 
229 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  46.86 
 
 
232 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  42.29 
 
 
224 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  41.33 
 
 
220 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  37.68 
 
 
260 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 
224 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 
224 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 
224 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  41.38 
 
 
224 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
230 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 
224 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 
224 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  40.89 
 
 
224 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  41.88 
 
 
229 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  41.38 
 
 
217 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  40.39 
 
 
224 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  42.36 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  40.39 
 
 
224 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  38.89 
 
 
221 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  38.89 
 
 
221 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  40.1 
 
 
224 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  41.36 
 
 
223 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  36.3 
 
 
259 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  40 
 
 
229 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 
230 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 
230 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  44.92 
 
 
227 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  37.92 
 
 
261 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  41.71 
 
 
224 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  37.32 
 
 
234 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  41.27 
 
 
222 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  41.27 
 
 
222 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  41.06 
 
 
230 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  41.62 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  44.2 
 
 
232 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  44.72 
 
 
221 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  41.36 
 
 
222 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  42.5 
 
 
230 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  42.29 
 
 
207 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  42.29 
 
 
207 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  42.37 
 
 
220 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  42.37 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  42.37 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  41.81 
 
 
220 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  41.81 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  41.33 
 
 
225 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  39.46 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  40.1 
 
 
224 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  45.16 
 
 
219 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  39.11 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  41.11 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  39.47 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  39.18 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  39.18 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  39.18 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  38.55 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  39.46 
 
 
239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  38.55 
 
 
233 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  38.46 
 
 
237 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  33.02 
 
 
247 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  36.23 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  39.77 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  38.76 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  35.32 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  40.33 
 
 
239 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  35.32 
 
 
217 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 
229 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 
228 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 
230 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  38.6 
 
 
230 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  39.78 
 
 
237 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  35.16 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  42.59 
 
 
228 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.1 
 
 
247 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.1 
 
 
247 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  35.6 
 
 
232 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  36.13 
 
 
232 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
238 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  40.21 
 
 
243 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>