215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3645 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  83.18 
 
 		 220 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  82.73 
 
 		 220 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  80.65 
 
 		 220 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  79.34 
 
 		 224 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  52 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  52.23 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 221 aa  217  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  49.32 
 
 		 221 aa  214  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  51.69 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  51.2 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  50.96 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  54.75 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  44.09 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  46.85 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  43.95 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  43.95 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  44.39 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  43.95 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  45.95 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  44.05 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  45.96 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  44.34 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  43.61 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  44.6 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  43.42 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  44.54 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  44.89 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  39.83 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  46.41 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  40.97 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  41.67 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  44.25 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  44.25 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  44.64 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  45.45 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  39.82 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  38.94 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  39.56 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  37.72 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  42.37 
 
 		 283 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  46.11 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  46.11 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  38.05 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  36.64 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  43.16 
 
 		 261 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  40.76 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  40.76 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  40.76 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  39.78 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  43.46 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  40.39 
 
 		 232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  36.61 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  38.71 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  39.38 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  43.98 
 
 		 260 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  38.99 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  38.57 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  36 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  39.89 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  36.53 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  42.19 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  34.1 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  39.9 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  37.29 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  38.42 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  34.93 
 
 		 240 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  37.29 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  37.29 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  37.29 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  37.62 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  36.07 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  35.43 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  36.59 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  34 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  34.22 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  36.22 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  33.18 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  33.18 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  31.39 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  35.65 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  30.99 
 
 		 247 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  40.23 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  32.72 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  32.72 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  39.06 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>