214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04915 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  95.07 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  65.53 
 
 		 232 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  59.9 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  54.46 
 
 		 220 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  52.86 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  53.99 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  59.41 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  53.42 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  53.52 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  63.28 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  53.85 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  51.15 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  50 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  44.14 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  44.14 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  43.69 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  43.05 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  47.11 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  41.87 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  44.5 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  42.34 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  42.99 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  47.91 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  40.87 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  40.43 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.79 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  40.69 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  43.12 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  44.54 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  41.4 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  44.85 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  48.11 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  48.74 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  41.81 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  41.55 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.88 
 
 		 283 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  44.27 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  44.27 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  37.12 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  40.09 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  40.09 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  38.6 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  42.78 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  42.78 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  42.25 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  42.25 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  42.25 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  41.71 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  37.77 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  37.9 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  38.01 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  36.2 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  38.14 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.59 
 
 		 225 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  40.31 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  36.84 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  37.37 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.95 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  36.82 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  38.42 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  38.42 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  35.89 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  34.98 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  35.35 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  37.71 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  37.11 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  36.89 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  39.88 
 
 		 232 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  36.24 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  38.42 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  35.5 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  34.83 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  37.17 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.49 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  38.29 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  36.41 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  36.2 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  36.2 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  37.21 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  33.47 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  40.68 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>