218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1770 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  46.55 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  47.91 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  44.26 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  46.06 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  45.64 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  46.95 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  43.85 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  43.16 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  43.98 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  43.16 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  44.93 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  42.74 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  43.15 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  42.15 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  40.5 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  45.28 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  43.7 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  42.74 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  44.24 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  44.08 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  43.35 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  43.35 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  42.55 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  43.67 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  39 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  43.54 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  40.77 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  41.4 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  40.43 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  41.98 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  41.63 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  44.5 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  39.75 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  42.16 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  41.52 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  41.94 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  41.94 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  41.47 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  41.47 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  39.06 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  39.73 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  41.31 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  39.73 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  40.47 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  38.91 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  38.96 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  38.91 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  39.34 
 
 		 261 aa  154  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  39.62 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  42.92 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  37.44 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  39.19 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  37.69 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  39.9 
 
 		 261 aa  151  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  41.01 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  37.66 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  39.64 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  40.71 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  38.57 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  36.36 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  36.36 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  40.09 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  41.06 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  39.38 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  41.44 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  39.53 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  41.31 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  41.36 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  38.57 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  40.69 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  40.69 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  44.19 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  43.6 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  40.76 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  37.05 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  42.99 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  40.44 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  42.61 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  41.89 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  42.29 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  42.05 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  41.89 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  42.52 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>