218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1531 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  72.69 
 
 
239 aa  331  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  78.3 
 
 
239 aa  329  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  76.85 
 
 
243 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  76.85 
 
 
229 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  74.34 
 
 
233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  70.54 
 
 
232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  75.94 
 
 
237 aa  321  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  71.68 
 
 
235 aa  317  9e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  74.65 
 
 
221 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  74.65 
 
 
221 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  74.65 
 
 
221 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  74.65 
 
 
221 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  74.65 
 
 
221 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  71.75 
 
 
232 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  71.43 
 
 
235 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  71.43 
 
 
235 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01075  flagellar L-ring protein precursor H  71.75 
 
 
232 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1202  flagellar basal body L-ring protein  71.75 
 
 
232 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1202  flagellar basal body L-ring protein  71.75 
 
 
232 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1458  flagellar basal body L-ring protein  71.75 
 
 
232 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.765592  hitchhiker  0.00069646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01083  hypothetical protein  71.75 
 
 
232 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  60.26 
 
 
232 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  62.1 
 
 
237 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  55.95 
 
 
224 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  59.53 
 
 
232 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  58.6 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  60.1 
 
 
229 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  54.94 
 
 
227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  57.21 
 
 
229 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  57.69 
 
 
229 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  58.1 
 
 
230 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  57.62 
 
 
229 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  57.62 
 
 
229 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  57.62 
 
 
229 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
240 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
240 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
238 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
222 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
240 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  57.08 
 
 
240 aa  225  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  56.87 
 
 
240 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  55.81 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  57.89 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  50.22 
 
 
244 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  49.34 
 
 
247 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  49.34 
 
 
247 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  50.46 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  47.09 
 
 
230 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  46.05 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  44.35 
 
 
222 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  43.16 
 
 
219 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  43.64 
 
 
224 aa  165  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  45.6 
 
 
243 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  39.65 
 
 
235 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  42.99 
 
 
222 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  47.13 
 
 
249 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  40.44 
 
 
230 aa  148  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  40.79 
 
 
232 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  37.55 
 
 
230 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  37.67 
 
 
226 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  38.52 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  45.13 
 
 
237 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  42.35 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  40.17 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  40.77 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  40.77 
 
 
231 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  40.34 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  38.01 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  40.31 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  39.38 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  38.59 
 
 
231 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  39.02 
 
 
260 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  39.22 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  39.59 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  37 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  38.22 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  38.17 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3833  flagellar L-ring protein  34.38 
 
 
238 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  40.22 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  41.12 
 
 
227 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  38.35 
 
 
237 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3106  flagellar L-ring protein  34.38 
 
 
238 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  38.35 
 
 
237 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  35.19 
 
 
223 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  38.31 
 
 
232 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  36.02 
 
 
234 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 
240 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 
261 aa  122  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  36.17 
 
 
230 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  36.17 
 
 
230 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  34.82 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  35.11 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  35.11 
 
 
221 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.62 
 
 
220 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  34.73 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  35.81 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  33.92 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>