214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000734 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  95.07 
 
 
229 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  66.02 
 
 
232 aa  288  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  60.39 
 
 
220 aa  252  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  54.02 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  52.68 
 
 
220 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  53.42 
 
 
220 aa  234  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  54.29 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  53.81 
 
 
221 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  53.11 
 
 
219 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  59.16 
 
 
221 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  61.45 
 
 
221 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  48.64 
 
 
224 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  49.49 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  43.04 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  43.5 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  43.5 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  43.05 
 
 
231 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  43.95 
 
 
231 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  43.5 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  43.5 
 
 
231 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  48.36 
 
 
221 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  41.28 
 
 
231 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  46.22 
 
 
226 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  45.79 
 
 
230 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  41.03 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  41.15 
 
 
237 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  40.71 
 
 
237 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  42.99 
 
 
232 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  48.37 
 
 
218 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  41.98 
 
 
230 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  51.74 
 
 
217 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  46.56 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  43.23 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  41.63 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  42.42 
 
 
224 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  42.61 
 
 
283 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  43.81 
 
 
207 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  43.81 
 
 
207 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  41.44 
 
 
234 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  37.12 
 
 
234 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  40.27 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  39.46 
 
 
230 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  39.46 
 
 
230 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  38.84 
 
 
224 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 
224 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 
224 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 
224 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 
224 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 
224 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  40.41 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  39.13 
 
 
224 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 
229 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  39.17 
 
 
224 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  37.34 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  37.44 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  37.12 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  38.86 
 
 
217 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  36.2 
 
 
233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  36.41 
 
 
228 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  36.87 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.95 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  37.56 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  35.41 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  35.96 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 
229 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  37.85 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 
229 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 
229 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 
229 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  36.17 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  37.76 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  36.64 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 
261 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  36.89 
 
 
230 aa  128  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  39.88 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.26 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.26 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  35.08 
 
 
247 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.42 
 
 
229 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
224 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  36.22 
 
 
236 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  33.64 
 
 
244 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  37.93 
 
 
230 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  35.81 
 
 
233 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  36.15 
 
 
237 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  38.02 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  34.5 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.49 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>