216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3156 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  60.09 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  59.66 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  50.86 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  53.67 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  37.18 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  35.66 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  40.74 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  36.29 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  35.47 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  41.8 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  36.86 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.54 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.05 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  33.88 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  35.37 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  34.33 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  33.91 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  35.17 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  35.59 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  31.62 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  35.17 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  35.37 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  32.77 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  34.31 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  35.2 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  32.71 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.51 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  35 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.21 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  31.67 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  31.53 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  31.74 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  31.74 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  34.27 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  32.64 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  28.51 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  32.2 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  31.67 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  32.92 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  36.57 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.09 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  35.45 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  31.06 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  29.54 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  34.27 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  33.46 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.87 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  28.94 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  33.48 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  32.55 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  31.49 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  31.84 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  32.48 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  32.52 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  29.6 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  29.58 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  31.67 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  29.74 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  29.86 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  28.27 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  30.64 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  31.09 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  30.63 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  31.03 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  28.51 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  35.59 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  27.27 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  28.87 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  30.41 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  34.34 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 252 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  27.03 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  28.87 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  32.64 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  27.9 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  30.68 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  33.71 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  31.65 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  28.38 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  33.51 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  29.57 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  30.49 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  30.13 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  34.27 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>