215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0814 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  66.53 
 
 		 235 aa  328  5.0000000000000004e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  65.67 
 
 		 235 aa  322  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  60 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  60 
 
 		 232 aa  298  4e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  59.57 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  58.72 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  57.21 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  49.58 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  36.4 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  32.89 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  34.31 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.61 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  32.91 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  32.91 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.2 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  33.49 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  31.9 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  29.36 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  34.72 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.54 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  30.45 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  33.19 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  30.21 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.2 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  31.36 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  32.98 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  28.45 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  27.35 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  30.74 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  30.15 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  28.89 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  30.73 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  30.93 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  28.4 
 
 		 259 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  31.02 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  28.29 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  29.29 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  30.7 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  31.25 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  30.83 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  28.51 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  30.89 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  28.19 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  31.18 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  29.36 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  28.39 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  27.73 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  28.88 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  29.94 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  33.66 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  26.23 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  27.73 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  30.16 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  26.81 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  32.2 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  28.51 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  25.85 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  28.29 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  26.72 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  25.32 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  31.28 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  26.16 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  28.03 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  27.12 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  27.71 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  30.51 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  27.12 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  28.99 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2592  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  27.54 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  30.51 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  26.52 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  30.2 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1874  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  26.52 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  26.05 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>