219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1949 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  100 
 
 
251 aa  507  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  49.8 
 
 
259 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  48.79 
 
 
252 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  48.18 
 
 
252 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  48.18 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  48.36 
 
 
252 aa  238  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  54 
 
 
244 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  47.18 
 
 
246 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  49.59 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  47.13 
 
 
252 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  46.37 
 
 
246 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  46.96 
 
 
252 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  48.37 
 
 
250 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  48.37 
 
 
250 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  48.52 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  47.23 
 
 
249 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  44.84 
 
 
244 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  49.78 
 
 
238 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  43.03 
 
 
234 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  45.15 
 
 
239 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  45.15 
 
 
239 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  42.19 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  44.22 
 
 
235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  43.8 
 
 
232 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  41.22 
 
 
235 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  41.34 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  43.28 
 
 
235 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  41.67 
 
 
237 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  42.04 
 
 
250 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  41.6 
 
 
232 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  43.91 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  44.59 
 
 
239 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  42.39 
 
 
236 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  39.3 
 
 
242 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 
242 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  41.35 
 
 
238 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  41.35 
 
 
238 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 
238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  39.84 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  41.06 
 
 
230 aa  158  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  39.68 
 
 
245 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  38.37 
 
 
242 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  38.89 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  39.11 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  37.38 
 
 
221 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.14 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  39.25 
 
 
229 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.66 
 
 
229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  36.32 
 
 
224 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  32.02 
 
 
229 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.89 
 
 
238 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.47 
 
 
226 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  35 
 
 
229 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.09 
 
 
239 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  33.8 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.55 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  36.31 
 
 
232 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.69 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  32.39 
 
 
229 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  31.92 
 
 
229 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  33.94 
 
 
229 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  33.68 
 
 
240 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  31.03 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  32.98 
 
 
232 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  33.71 
 
 
232 aa  92  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 
237 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  31.28 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  28.57 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.67 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  29.15 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  31.94 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  31.98 
 
 
192 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  31.94 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  29.6 
 
 
237 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  33.72 
 
 
222 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  27.45 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  36.25 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  30.2 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  30.81 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  28.02 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  32.83 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  33.93 
 
 
192 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  29.81 
 
 
240 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  34.19 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  34.19 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  29.7 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  27.2 
 
 
224 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  29.47 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0395  flagellar L-ring protein  33.15 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  29.95 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  29.58 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  28.99 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>