219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0291 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  53.45 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  52.63 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  53.09 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  53.72 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  51.74 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  52.25 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  51.8 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  51.54 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  50 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  49.34 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  50 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  50.23 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  47.81 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  47.21 
 
 		 344 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  44.49 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  42.86 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  44.58 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  42.44 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  44.07 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  45.58 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  45.58 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  42.51 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  41.77 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  45.54 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  45.31 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  40.51 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  42.92 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  41.99 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  42.06 
 
 		 252 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  41.6 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  39.84 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  41.67 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  45.58 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  43.58 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  42.92 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  36.67 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  41.84 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  33.05 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.6 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  31.15 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  33.2 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  32.34 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  32.17 
 
 		 221 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  31.05 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.13 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  29.74 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  31.36 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  28.81 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  28.22 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  28.81 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  28.93 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  34 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  28.27 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  29.49 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  30.21 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  31.87 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  31.18 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  30.25 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  30.65 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  28.76 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  31.25 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  32.75 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  34.48 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  30.9 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  31.76 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  32.2 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  27.16 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  31.64 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  29.31 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.2 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  31.07 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  32.37 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  30.8 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  30.8 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  31.58 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  30.47 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  31.91 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  31.46 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  27.85 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 192 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  30.7 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  30.51 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  33.73 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  32.57 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  32.11 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  30.49 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  30.49 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  30.49 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  29.06 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>