219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0031 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  68.26 
 
 		 344 aa  330  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  52.97 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  50.21 
 
 		 232 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  49.79 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  47.83 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  49.08 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  49.57 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  48.81 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  48.81 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  48 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  46.79 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  50.45 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  50 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  46.28 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  44.49 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  46.49 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  42.11 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  39.36 
 
 		 252 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  42.51 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  41.8 
 
 		 250 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  41.8 
 
 		 250 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  41.8 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  41.2 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  40.4 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  45.57 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  41.95 
 
 		 251 aa  174  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  39.6 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  39.66 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  42.15 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  44.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  44.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  40.16 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  39.66 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.74 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  43.18 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  43.36 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  38.08 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  37.45 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  39.33 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.74 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  34.91 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  37.44 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.62 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  33.75 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  36.63 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  33.64 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  32.24 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  30.87 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  36.27 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  31.96 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  30.2 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  34.83 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  35.39 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  35.96 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  32.58 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  32.58 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  30.6 
 
 		 192 aa  95.1  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  29.32 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  28.89 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  32.98 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  28.15 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  27.6 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  27.2 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  29.18 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  29.17 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  31.21 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  28.87 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  30.64 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  25.31 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  28.39 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  28.93 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  28.11 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  29.54 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  29.54 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  28.76 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  27.16 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  26.69 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  24.9 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  29.67 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  29.02 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  30.21 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  32.18 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.79 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  29.78 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  24.48 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  32.18 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  29.82 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  28.34 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  24.89 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  28.44 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  25.62 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>