217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16550 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  100 
 
 
192 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  38.33 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.48 
 
 
226 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  36.36 
 
 
229 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  35.98 
 
 
230 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  34.74 
 
 
192 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  32.64 
 
 
224 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  35.79 
 
 
231 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  38.71 
 
 
229 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  33.7 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.52 
 
 
234 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
232 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  33.51 
 
 
239 aa  111  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  34.29 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 
238 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.37 
 
 
229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  31.28 
 
 
238 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35.43 
 
 
232 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  33.71 
 
 
259 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  34.97 
 
 
224 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  33.7 
 
 
201 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  31.49 
 
 
229 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  31.49 
 
 
229 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 
230 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  32.14 
 
 
261 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  32.12 
 
 
261 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  31.43 
 
 
230 aa  101  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  31.76 
 
 
236 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
230 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  29.21 
 
 
223 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  32.93 
 
 
226 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  31.11 
 
 
229 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  32.02 
 
 
260 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  27.75 
 
 
237 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0048  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
187 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  29.84 
 
 
231 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  29.32 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  28.42 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  28.42 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  27.51 
 
 
237 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  28.65 
 
 
231 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  32.35 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  29.32 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  32.35 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  31.43 
 
 
224 aa  95.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  28.28 
 
 
240 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  28.8 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  30.6 
 
 
233 aa  95.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  29.89 
 
 
252 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  28.8 
 
 
231 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  32.08 
 
 
237 aa  94.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 
252 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
235 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  36.14 
 
 
224 aa  94  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 
250 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  30.25 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  32.08 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  30.48 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  27.41 
 
 
255 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  30.99 
 
 
344 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  30.9 
 
 
235 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  26.26 
 
 
221 aa  91.3  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  32.76 
 
 
236 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  32.04 
 
 
234 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  30.49 
 
 
229 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  30.1 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  26.26 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  31.93 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  32.24 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  35.4 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  34.76 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  26.84 
 
 
252 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  35.4 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  28.88 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  35.4 
 
 
244 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  29.1 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  29.1 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
229 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  31.84 
 
 
217 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  28.49 
 
 
224 aa  88.6  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  28.34 
 
 
252 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  28.8 
 
 
239 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  31.98 
 
 
251 aa  89  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  31.14 
 
 
232 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  31.21 
 
 
232 aa  88.6  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  29.88 
 
 
223 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  30.43 
 
 
235 aa  88.2  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  30.27 
 
 
244 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  28.11 
 
 
252 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  29.1 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  32.95 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  33.14 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  27.51 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  27.81 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  28.93 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>