219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3269 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  99.6 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  97.2 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  78.05 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  77.64 
 
 		 246 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  78.31 
 
 		 249 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  64.08 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  63.24 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  64.9 
 
 		 252 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  65.31 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  64.49 
 
 		 252 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  64.49 
 
 		 252 aa  321  6e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  63.67 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  51.74 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  54.92 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  48.48 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  45.19 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  45.58 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  45.58 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  43.98 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  42.8 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  49.73 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  43.5 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  41.7 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  41.84 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  42.39 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  41.8 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  45.26 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  40.08 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  43.21 
 
 		 236 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  41.37 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  41.3 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  40.95 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  41.13 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  40.95 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  38.02 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  40.74 
 
 		 344 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  40.69 
 
 		 235 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  41.39 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  44.09 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  41.13 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  40.32 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.3 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  37.63 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  34.47 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.23 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  36.36 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  30.8 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  34.62 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.16 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.2 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  34.44 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.43 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.74 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  31.45 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  33.64 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.56 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  33.89 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.11 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.03 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  32.43 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  30.98 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  31.07 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  31.6 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.45 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  29.33 
 
 		 220 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  29.55 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  29.73 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  35.9 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  33.17 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  29.9 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  29.67 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  30.34 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  32.2 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  28.81 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  29.91 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  32.42 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  30.33 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  29.39 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  32.12 
 
 		 232 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7233  putative flagellar L-ring protein FlgH  33.5 
 
 		 221 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  31.94 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  29.08 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  29.69 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  26.67 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  30.09 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  31.32 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  32.86 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  29.09 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  28.99 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>