217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3098 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  43.29 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  39.65 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  38.33 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  38.32 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  40.18 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  38.57 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  41.18 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  35.04 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  37.85 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  43.32 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  43.24 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  35.43 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  37.82 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  34.05 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  41.29 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  34.21 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  33.78 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  33.78 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  32.13 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  37.16 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  34.51 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  33.62 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  31.22 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  38.19 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  32.43 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  34.65 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  32.43 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  35.68 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  34.51 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  32.07 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  33.89 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  33.89 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  36.82 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  30.6 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  37.62 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  33.94 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  37.32 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  36.82 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  32.11 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  39.39 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  31.15 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.45 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  35.05 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  31.65 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  35.82 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  35.27 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  33.94 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  36.5 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  36.18 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  35.59 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  31.91 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  35.94 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  36.32 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  38.31 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  35.68 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  37.43 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  36.76 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  36.87 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  37.16 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  34.6 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  33.62 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  33.62 
 
 		 243 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  35 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.58 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  33.62 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  36.87 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  34.63 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  32.73 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  32.88 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  31.76 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  35 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  36.31 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>