218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1376 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  100 
 
 
224 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.25 
 
 
229 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 
224 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  36.82 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  32.03 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  31.03 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  34.38 
 
 
229 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  31.72 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  32.88 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  30.36 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  31.53 
 
 
231 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  30.67 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  32.17 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  31.14 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.91 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  33.77 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  34.13 
 
 
244 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  30.8 
 
 
237 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  34.86 
 
 
231 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  33.73 
 
 
247 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  33.73 
 
 
247 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  34.43 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  33.15 
 
 
229 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  31.51 
 
 
240 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  31.11 
 
 
224 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
229 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  36 
 
 
231 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.27 
 
 
229 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
230 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  30.71 
 
 
238 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  32.39 
 
 
224 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  25.94 
 
 
240 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  32.89 
 
 
224 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  30.22 
 
 
231 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  30.88 
 
 
225 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
230 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  35.43 
 
 
231 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  32.73 
 
 
232 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 
229 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  31.12 
 
 
233 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  31.78 
 
 
229 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
224 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  33.16 
 
 
227 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  32.47 
 
 
230 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  29.69 
 
 
238 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  31.36 
 
 
237 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  28.57 
 
 
227 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  33.53 
 
 
229 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  32.22 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  31.62 
 
 
224 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  30.94 
 
 
224 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  32.22 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  29.74 
 
 
229 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  32.22 
 
 
229 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  31.44 
 
 
229 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  30.04 
 
 
235 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  31.67 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  32.22 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  34.63 
 
 
259 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  31.12 
 
 
232 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  32.88 
 
 
224 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  31.67 
 
 
229 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  32.86 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  31.28 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  32.78 
 
 
234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  31.03 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  31.67 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  31.36 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  31.12 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  31.37 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  31.12 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  30.91 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  33.01 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  29.63 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  31.34 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  35.05 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  29.41 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  33.98 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  33.73 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  32.54 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  32.54 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  32.06 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  32.06 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  36.31 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  36.31 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  29.07 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  30.59 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>