217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2779 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3581  flagellar L-ring protein  84 
 
 
223 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0077729  hitchhiker  0.00000182605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0377  putative flagellar L-ring protein precursor(basal body L-ring protein), FlgH  82.18 
 
 
239 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  37.85 
 
 
219 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  39.53 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  34.39 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  36.36 
 
 
224 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 
234 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  35.1 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3720  flagellar L-ring protein  41.18 
 
 
243 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  36.76 
 
 
229 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 
229 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  37.2 
 
 
236 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 
229 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 
229 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 
229 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  37.5 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  34.26 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  36.36 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  35.29 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  37.2 
 
 
230 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  33.82 
 
 
234 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  36.41 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 
233 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  34.43 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  38.31 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  34.62 
 
 
224 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.38 
 
 
229 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  32.44 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  35.78 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  34.15 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  33.83 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  33.19 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  32.53 
 
 
237 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  36.46 
 
 
240 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  33.02 
 
 
223 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  33.78 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  33.17 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  33.17 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  33.17 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  33.17 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  35.32 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  31.58 
 
 
244 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  32.07 
 
 
237 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  31.51 
 
 
230 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4426  flagellar L-ring protein  35.03 
 
 
237 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  31.9 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 
217 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  41.54 
 
 
207 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  41.54 
 
 
207 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  33.79 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  33.7 
 
 
230 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  33.7 
 
 
230 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1531  flagellar L-ring protein  36.02 
 
 
228 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  35.91 
 
 
232 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  28.76 
 
 
236 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  33.62 
 
 
247 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  33.62 
 
 
247 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  31.02 
 
 
220 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  34.5 
 
 
231 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  34.65 
 
 
231 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2964  flagellar basal body L-ring protein  37.33 
 
 
233 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.446347  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  33.49 
 
 
224 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  31.02 
 
 
220 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  32.33 
 
 
232 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  32.37 
 
 
224 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 
231 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  31.75 
 
 
221 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  35.29 
 
 
231 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0563  flagellar L-ring protein  33.15 
 
 
249 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  32.97 
 
 
222 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 
231 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2419  flagellar basal body L-ring protein  37.73 
 
 
229 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  32.23 
 
 
240 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  31.28 
 
 
221 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  30.37 
 
 
228 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2318  flagellar basal body L-ring protein  37.73 
 
 
243 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  34.31 
 
 
220 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  29.49 
 
 
230 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
230 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  27.68 
 
 
250 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  31.77 
 
 
219 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  34.09 
 
 
231 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2049  flagellar basal body L-ring protein  37.57 
 
 
232 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  33.51 
 
 
229 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  36.46 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>