More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0927 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  60.8 
 
 		 200 aa  248  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  64.18 
 
 		 201 aa  241  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  63 
 
 		 217 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  60.8 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  53 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  56.06 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  63.58 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  50.75 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  52.74 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  52.74 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  45.5 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  46.27 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  45.27 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  46.73 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  45.77 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  36.42 
 
 		 245 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 274 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 270 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  32.26 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  29.67 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  29.67 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.71 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5938  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.43 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  decreased coverage  0.00196456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4242  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  31.5 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6088  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2677  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2810  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2778  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.86 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.78 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2277  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.71 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000536338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  27.22 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4201  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.05 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.622322  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.78 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  32.56 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  25.25 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  24.12 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  28.81 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1941  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.9 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923131  normal  0.859754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.639156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>