58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5378 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  47.62 
 
 		 274 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  49.61 
 
 		 472 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  54.46 
 
 		 274 aa  128  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  48.57 
 
 		 506 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  51.46 
 
 		 804 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  48 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  48.51 
 
 		 276 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  46.15 
 
 		 275 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  45.63 
 
 		 288 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  37.68 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  45.71 
 
 		 230 aa  100  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  44.76 
 
 		 279 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  46.15 
 
 		 279 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  32.91 
 
 		 413 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  37.9 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  40.18 
 
 		 668 aa  95.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  41.9 
 
 		 438 aa  94.7  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  44.35 
 
 		 484 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  46.08 
 
 		 485 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  40 
 
 		 604 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  38.78 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  27.4 
 
 		 379 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  37 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  36.08 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  30.83 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  35.35 
 
 		 489 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  33.33 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  30.65 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  36.56 
 
 		 583 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  32.2 
 
 		 276 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  36.55 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.58 
 
 		 258 aa  63.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  27.14 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  37.04 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  37.33 
 
 		 446 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  28.7 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  31.01 
 
 		 467 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.1 
 
 		 447 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  29.81 
 
 		 238 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  30.53 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  24.73 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.79 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  28.69 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  28 
 
 		 253 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  36.49 
 
 		 437 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  25.32 
 
 		 614 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  30.67 
 
 		 357 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.37 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  35.62 
 
 		 265 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  27.83 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  30.33 
 
 		 441 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  27.4 
 
 		 251 aa  40.8  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.67 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.28 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.33 
 
 		 275 aa  40.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0798  TonB family protein  29.67 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>