More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4279 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  100 
 
 		 144 aa  291  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  48.87 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  59.6 
 
 		 186 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 198 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 323 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 227 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 324 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  51.49 
 
 		 200 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  50 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  49.02 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 199 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 270 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 367 aa  107  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  50.53 
 
 		 267 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  50.88 
 
 		 371 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  54.74 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.66 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  50.86 
 
 		 261 aa  105  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  49.46 
 
 		 267 aa  104  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  52 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  45.69 
 
 		 311 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.33 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 324 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.33 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  45 
 
 		 239 aa  104  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 206 aa  103  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  46.09 
 
 		 214 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  48.08 
 
 		 277 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 242 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 230 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  48.08 
 
 		 277 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  48.08 
 
 		 277 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 242 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 230 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 211 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 211 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.65 
 
 		 211 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  47.57 
 
 		 249 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 279 aa  102  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 263 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 259 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 260 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 381 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 280 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 280 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 280 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 318 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  45.22 
 
 		 264 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  44.64 
 
 		 275 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 283 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.6 
 
 		 243 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  44.64 
 
 		 275 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  50 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  44.64 
 
 		 266 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  52.87 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  50.44 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  41.48 
 
 		 322 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 265 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 281 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 203 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 213 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  50 
 
 		 240 aa  100  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 259 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  51.33 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  50 
 
 		 221 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 278 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  53.85 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  45.95 
 
 		 297 aa  99.4  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 212 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>