114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3912 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 222 aa  463  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  57.77 
 
 		 215 aa  265  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  48.85 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  48.24 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  48 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  44.5 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  42.03 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  41.46 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  40.89 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  39.9 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  42.2 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  41.86 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  41.86 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  37.16 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  35.65 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  31.94 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  31.94 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  25.22 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  30.16 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  27.31 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  31.06 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  25.93 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  34.71 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  34.71 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  29.05 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  27.06 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  34.75 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  27.74 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  23.48 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  32.77 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  35.96 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.53 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.12 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  33.05 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  25.19 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.76 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  28.89 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.76 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  25.71 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  30.28 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  31.62 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  27.97 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  28.36 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  28.97 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  27.89 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32.09 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  35.65 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  36.99 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  30.53 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  28.26 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  35.35 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  35.35 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  30.23 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.86 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  26.03 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5793  protein of unknown function DUF218  31.33 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  30.53 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.4 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  24.49 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  32.56 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.56 
 
 		 264 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.09 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  38.46 
 
 		 345 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1588  hypothetical protein  35.35 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  33.82 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  34.88 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  36.76 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  27.2 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.09 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.07 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  38.1 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  29.47 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  30.4 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  27.66 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  35.82 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>