More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3350 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  100 
 
 		 1127 aa  2327    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  57.76 
 
 		 1129 aa  1310    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  54.9 
 
 		 1130 aa  1261    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  46.92 
 
 		 1261 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  41.81 
 
 		 1250 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  39.78 
 
 		 959 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  41.95 
 
 		 1068 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  44.21 
 
 		 1055 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 982 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 		 1021 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  43.68 
 
 		 1112 aa  498  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  43.45 
 
 		 1066 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  43.32 
 
 		 1003 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  44.18 
 
 		 977 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  42.16 
 
 		 964 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.74 
 
 		 1062 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.25 
 
 		 1091 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.48 
 
 		 1068 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 		 1069 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.02 
 
 		 1071 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  38.27 
 
 		 1086 aa  413  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 1068 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.87 
 
 		 1068 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 1120 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  44.35 
 
 		 914 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 		 1104 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  40.21 
 
 		 1134 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  44.15 
 
 		 918 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  41.28 
 
 		 872 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  44.86 
 
 		 896 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42.97 
 
 		 1080 aa  386  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  39.65 
 
 		 985 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 1171 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.97 
 
 		 1082 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.78 
 
 		 1110 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  42.48 
 
 		 1088 aa  379  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.28 
 
 		 1073 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  43.7 
 
 		 1100 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.62 
 
 		 1091 aa  376  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.92 
 
 		 1209 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  39.01 
 
 		 1087 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  45.07 
 
 		 773 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  39.14 
 
 		 876 aa  373  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  41.38 
 
 		 1070 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  45.49 
 
 		 663 aa  373  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  41.39 
 
 		 1181 aa  367  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  43.2 
 
 		 1105 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  43.43 
 
 		 1088 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1088 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 		 1090 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 		 1108 aa  370  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  44.02 
 
 		 1125 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  43.37 
 
 		 1077 aa  369  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  37.87 
 
 		 891 aa  366  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  43.15 
 
 		 1178 aa  366  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  37.91 
 
 		 1110 aa  366  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  40.99 
 
 		 1070 aa  365  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  37.32 
 
 		 1150 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.35 
 
 		 1102 aa  364  6e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 1073 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  44.47 
 
 		 1105 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  44.47 
 
 		 666 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  39.89 
 
 		 1069 aa  363  8e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  40.76 
 
 		 1082 aa  363  9e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  41.05 
 
 		 1073 aa  363  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  40.76 
 
 		 1082 aa  363  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 		 1113 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  42.34 
 
 		 1113 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.95 
 
 		 1082 aa  362  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  41.35 
 
 		 1161 aa  362  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 		 1112 aa  361  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  39.7 
 
 		 1069 aa  360  6e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  43.3 
 
 		 1362 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 1073 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.82 
 
 		 1403 aa  360  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 1073 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  43.53 
 
 		 1386 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  37.04 
 
 		 1159 aa  357  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  35.62 
 
 		 1154 aa  357  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 		 1155 aa  356  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  42.35 
 
 		 1084 aa  355  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 1139 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 950 aa  353  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  41.58 
 
 		 1086 aa  353  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.03 
 
 		 991 aa  353  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  36.57 
 
 		 1072 aa  352  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  37.62 
 
 		 1284 aa  352  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  44.58 
 
 		 1357 aa  351  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  42.14 
 
 		 1084 aa  351  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  33.98 
 
 		 1031 aa  350  7e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  35.55 
 
 		 1025 aa  350  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 		 1028 aa  350  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  43.09 
 
 		 1437 aa  349  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 966 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.82 
 
 		 1082 aa  346  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.1 
 
 		 1227 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  36.79 
 
 		 1120 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  41.39 
 
 		 1013 aa  346  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 1089 aa  345  2.9999999999999997e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  36.48 
 
 		 1120 aa  345  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>