252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1334 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 449 aa  916    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  77.28 
 
 		 439 aa  721    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.69 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.71 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.46 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.82 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.51 
 
 		 443 aa  339  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.48 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.17 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  29 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  28.6 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.74 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  28.57 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.49 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.5 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  26.21 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  27.88 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  28.09 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  29.51 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  29.48 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  31.76 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  28.09 
 
 		 472 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  28.39 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  29.48 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  29.48 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  34.06 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  33.12 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  28.6 
 
 		 459 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.81 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.78 
 
 		 452 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.76 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  24.03 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  23.57 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.84 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.16 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.62 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  23.3 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  23.45 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  24.07 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  24.84 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.92 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.14 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  22.45 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  23.5 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  24.7 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  23.77 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.12 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  26.79 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  21.77 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.23 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  20.41 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.45 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  23.45 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.67 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  24.13 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  23.24 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  21.27 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  23.24 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  23.68 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  23.58 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.63 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  24.32 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  24.32 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  23.68 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.33 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  21.71 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  25.08 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  21.8 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.27 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  21.71 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.19 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.72 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.48 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  24.18 
 
 		 453 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  21.76 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  21.52 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  21.78 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  21.78 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.49 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.53 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  21.78 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.36 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  21.76 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  21.81 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  21.78 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  24.72 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.36 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.02 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.25 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  22.46 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  21.63 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  22 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  21.1 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  21.08 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>