More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 732 aa  1378    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  55.39 
 
 		 807 aa  635  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  53.21 
 
 		 737 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  46.38 
 
 		 1058 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  46.14 
 
 		 734 aa  495  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  45.37 
 
 		 734 aa  492  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  45.18 
 
 		 731 aa  489  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  46.77 
 
 		 729 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  45.34 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  44.97 
 
 		 735 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  44.37 
 
 		 728 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  44.91 
 
 		 832 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  43.84 
 
 		 735 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  44.53 
 
 		 793 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  48.18 
 
 		 726 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  44.75 
 
 		 734 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  43.43 
 
 		 755 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  46.87 
 
 		 738 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  43.76 
 
 		 737 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  39.35 
 
 		 779 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  45.2 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  40.62 
 
 		 779 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  41.07 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 		 829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.7 
 
 		 743 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 		 829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  48.77 
 
 		 726 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  43.49 
 
 		 854 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.25 
 
 		 732 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  40.71 
 
 		 917 aa  389  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  44.79 
 
 		 1092 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  37.99 
 
 		 909 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  41.75 
 
 		 1002 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  41.37 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.35 
 
 		 920 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.35 
 
 		 746 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  41.37 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  41.21 
 
 		 772 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  44.63 
 
 		 840 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.57 
 
 		 729 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  42.02 
 
 		 843 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.13 
 
 		 742 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  43.04 
 
 		 791 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 		 1382 aa  364  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  41.96 
 
 		 958 aa  363  8e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.89 
 
 		 732 aa  360  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32.72 
 
 		 893 aa  360  7e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  38.69 
 
 		 787 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.47 
 
 		 704 aa  358  2.9999999999999997e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  36.92 
 
 		 876 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.11 
 
 		 760 aa  356  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.7 
 
 		 842 aa  355  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  38.62 
 
 		 717 aa  351  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  41.6 
 
 		 784 aa  348  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.64 
 
 		 735 aa  344  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.84 
 
 		 758 aa  340  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.26 
 
 		 735 aa  339  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.7 
 
 		 718 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.96 
 
 		 751 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.12 
 
 		 752 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.92 
 
 		 737 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 903 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.28 
 
 		 715 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  41.11 
 
 		 903 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  36.14 
 
 		 726 aa  312  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.33 
 
 		 749 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.09 
 
 		 781 aa  294  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.03 
 
 		 723 aa  290  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.47 
 
 		 711 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.95 
 
 		 796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.25 
 
 		 761 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.91 
 
 		 714 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.27 
 
 		 740 aa  271  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.42 
 
 		 724 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.07 
 
 		 979 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.07 
 
 		 983 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.07 
 
 		 983 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.85 
 
 		 750 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.5 
 
 		 968 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.4 
 
 		 978 aa  250  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.43 
 
 		 743 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  35.22 
 
 		 836 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.89 
 
 		 758 aa  231  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.21 
 
 		 966 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.66 
 
 		 733 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.04 
 
 		 738 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.63 
 
 		 740 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.47 
 
 		 743 aa  220  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.09 
 
 		 846 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.45 
 
 		 730 aa  210  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.07 
 
 		 736 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.64 
 
 		 710 aa  207  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.39 
 
 		 730 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.67 
 
 		 730 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.7 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.96 
 
 		 766 aa  205  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.21 
 
 		 741 aa  203  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.16 
 
 		 730 aa  202  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.26 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.7 
 
 		 730 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>