More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1310 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.22 
 
 		 667 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.27 
 
 		 667 aa  866    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  62.22 
 
 		 667 aa  810    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.36 
 
 		 667 aa  945    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.22 
 
 		 667 aa  889    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.59 
 
 		 666 aa  752    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.27 
 
 		 667 aa  870    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.31 
 
 		 667 aa  983    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.62 
 
 		 667 aa  859    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.62 
 
 		 667 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.37 
 
 		 667 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.07 
 
 		 667 aa  888    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.79 
 
 		 668 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 667 aa  1353    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.77 
 
 		 667 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 683 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  32.02 
 
 		 678 aa  343  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 		 658 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 		 658 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 658 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.04 
 
 		 632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  30.76 
 
 		 656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.75 
 
 		 646 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  30.31 
 
 		 661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 		 646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 		 672 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.19 
 
 		 646 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.22 
 
 		 651 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 		 662 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 662 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 		 660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.49 
 
 		 659 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 656 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.28 
 
 		 660 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.77 
 
 		 651 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 		 651 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 660 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 651 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  28.68 
 
 		 676 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  29.12 
 
 		 687 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  30.23 
 
 		 678 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 643 aa  218  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  30.1 
 
 		 684 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 674 aa  217  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 		 719 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  30.76 
 
 		 656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.1 
 
 		 677 aa  211  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 680 aa  206  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  29.4 
 
 		 580 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 680 aa  203  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 674 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 		 674 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.86 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.86 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  29.61 
 
 		 684 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 670 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 		 630 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 		 626 aa  194  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.49 
 
 		 630 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  31.38 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.21 
 
 		 648 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 		 630 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 		 640 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 630 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 		 627 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.44 
 
 		 630 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  29.28 
 
 		 623 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.6 
 
 		 626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 639 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 713 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 645 aa  184  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 		 640 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.67 
 
 		 773 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 554 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  31.88 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  30.72 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  29.22 
 
 		 632 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  30.31 
 
 		 627 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.9 
 
 		 712 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  29.48 
 
 		 632 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 671 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 716 aa  180  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  30.19 
 
 		 629 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 546 aa  180  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.25 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  30.86 
 
 		 646 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 572 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  29.88 
 
 		 629 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  35.61 
 
 		 712 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 646 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 542 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 636 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 620 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 620 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.71 
 
 		 686 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>