198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2484 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3559  chitinase  58.87 
 
 
997 aa  859    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  55.01 
 
 
772 aa  826    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  56.14 
 
 
904 aa  881    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  97.43 
 
 
1127 aa  2263    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  54.53 
 
 
1146 aa  1070    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  52.3 
 
 
1054 aa  990    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  97.43 
 
 
1127 aa  2264    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  97.69 
 
 
1127 aa  2279    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  68.44 
 
 
1129 aa  1578    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  58.58 
 
 
855 aa  797    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  53.99 
 
 
1051 aa  936    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  45.34 
 
 
760 aa  674    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1127 aa  2328    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  52.04 
 
 
1053 aa  986    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 
484 aa  227  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.48 
 
 
372 aa  187  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.72 
 
 
703 aa  184  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 
652 aa  171  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 
674 aa  170  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.34 
 
 
674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  27.29 
 
 
639 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.34 
 
 
674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  40.14 
 
 
1152 aa  169  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.34 
 
 
674 aa  168  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.46 
 
 
674 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.46 
 
 
674 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.46 
 
 
674 aa  168  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.34 
 
 
674 aa  167  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.74 
 
 
674 aa  167  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.14 
 
 
674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 
674 aa  165  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 
482 aa  160  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  36.76 
 
 
846 aa  155  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.61 
 
 
634 aa  152  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.61 
 
 
846 aa  140  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  34.94 
 
 
846 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  25.36 
 
 
1271 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  25.79 
 
 
431 aa  135  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  26.26 
 
 
848 aa  134  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  25.99 
 
 
848 aa  131  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  33.21 
 
 
848 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  26.19 
 
 
855 aa  126  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  26.46 
 
 
559 aa  126  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  25.76 
 
 
396 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  33.9 
 
 
1406 aa  125  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  29.27 
 
 
521 aa  122  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  24.88 
 
 
377 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  24.63 
 
 
414 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  25.77 
 
 
652 aa  116  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  27.74 
 
 
854 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
1578 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  22.97 
 
 
1080 aa  114  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.32 
 
 
1047 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  23.37 
 
 
505 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  24.16 
 
 
499 aa  113  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.58 
 
 
373 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  26.68 
 
 
868 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  25.65 
 
 
868 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  29.49 
 
 
869 aa  112  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 
868 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
1782 aa  111  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  26.57 
 
 
867 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  25.35 
 
 
868 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.67 
 
 
398 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  29.2 
 
 
1246 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
868 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  29.97 
 
 
401 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.57 
 
 
382 aa  109  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 
863 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  27.02 
 
 
455 aa  108  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  28.98 
 
 
1443 aa  108  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  24.76 
 
 
762 aa  108  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  30.82 
 
 
1285 aa  108  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  26.82 
 
 
972 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  27.37 
 
 
425 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 
355 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  25.51 
 
 
430 aa  105  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  28.69 
 
 
1132 aa  104  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.07 
 
 
763 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  35.26 
 
 
1123 aa  103  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 
472 aa  102  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  25.86 
 
 
563 aa  101  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.12 
 
 
463 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 
388 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  22.78 
 
 
657 aa  98.2  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  24.64 
 
 
868 aa  97.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  39.59 
 
 
482 aa  96.3  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  26.64 
 
 
451 aa  94.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.13 
 
 
675 aa  94.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  28.36 
 
 
586 aa  93.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.75 
 
 
662 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  32.08 
 
 
1219 aa  91.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  30.03 
 
 
532 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 
465 aa  89  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 
1598 aa  88.6  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  26.85 
 
 
536 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  26.2 
 
 
542 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  23.21 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  26.93 
 
 
792 aa  85.5  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>